研究者指出 , 当LDA分数截止值大于4时 , 不同组患者间有显著差异的细菌物种主要是多种乳酸杆菌(图3) 。 与其他三组相比 , L.sakei在GERD组中显著富集(p
大肠杆菌在食管腺癌患者中显著富集(图3) 。
图3在种水平上 , 不同组患者LEfSe分析结果
为验证上述结果 , 研究者整合这5种特异性菌种(L.sakei、L.curvatus、C.stercoris、B.stercoris和E.coli) , 开发了基于mbDNA的宏基因组食管腺癌诊断工具 。
研究者使用逻辑回归模型 , 对该工具的诊断性能进行了验证 。 ROC曲线显示 , 该工具对GERD和食管腺癌的鉴别表现出优秀的性能 , AUC值为0.89 , 最佳灵敏度为60% , 特异性为95%(图4) 。

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【BJC:科学家首次发现,血液微生物DNA可用于食管癌的早筛和预后!】图4宏基因组工具表现出优秀的食管腺癌早筛效果
那么宏基因组能否用于预测食管腺癌患者生存期呢?研究者以食管腺癌患者总生存期(OS)是否达到24个月为标准 , 将患者分为两类:OS
研究者对不同类别患者的样本进行了LEfSe分析 。 研究者发现 , 沙门氏菌噬菌体球衣(Salmonellaphagejersey)和大肠杆菌病毒P1(EscherichiavirusP1)在OS≥24个月组中显著富集(图5a) 。 随后 , 研究者构建了一个包含这两种噬菌体和大肠杆菌的宏基因组工具 , 用于预测食管腺癌患者的生存期 。
当该工具与患者临床TNM分期相结合时 , ROC曲线显示 , 该工具对鉴别OS≥24个月的患者表现出不俗的性能 , AUC为0.84 , 最佳灵敏度86% , 特异性65%(图5b) 。
此外 , 与单独使用临床TNM分期相比 , 当TNM分期与宏基因组结合时 , 后者能够预测更长的OS , 风险比(HR)为6.23(p
(图5c) 。

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图5宏基因组特征可作为食管腺癌患者预测OS的生物标志物
总的来说 , 该研究首次表明 , 基于循环mbDNA的宏基因组在食管腺癌早筛和预后诊断中具有强大的生命力 。 此外 , 该研究鉴定的与食管腺癌诊断和预后相关的重要微生物 , 未来或可成为潜在的治疗靶点 。

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